GitLab

Pour l'instant, l'export des données est compliquée car se trouvent dans deux dossiers distincts: results/06_assignement/04_table/* ainsi que 05_clustering/02_otu_table/* avec des noms identiques pour tous les projets

Pour simplifier l'export des données du pipeline, il faudrait modifier deux éléments:

• mettre à jour le script rename.sh pour renommer les fichiers à exporter et les identifier correctement
• peut être rajouter une ligne de code pour bouger les fichiers d'intéret dans un dossier "final" pour faciliter leur téléchargement et limiter le risque d'erreur