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 Nous allons essayer de containeuriser une application qui permet de compter le nombre de séquences dans un fichier fasta :
 
 grep permet de compter l'occurence des '>' en début de chaque identifiant de séquence :
+
 grep -c '>' test.fa
 
 On peut également écrire un script R utilisant le package seqinr pour lire le fichier fasta et compter le nombre de séquences 
@@ -27,18 +28,23 @@ Depuis le dossier contenant le fichier Dockefile on construit l'mage en tapant :
 docker build -t count-seq-image .
 
 Pour lancer un conteneur :
+
 docker run -p 80:80 count-seq-image
 
 dans votre navigateur ouvrir cette url :
-127.0.0.1/src/count-seq.php
+
+http://127.0.0.1/src/count-seq.php
 
 pour examiner ce qu'il y à l'intérieur du container
+
 docker run -i -t count-seq-image /bin/bash
 
 
 Ajouter une sequence puis re-consulter l'URL
-Commenter
 
-Comment travailler sur les données de l'hôte
+Commenter le résultat.
+
+Jusqu'ici, le script analysait les données du fichier intégré dans le container, pour travailler sur les données de l'hôte
+
 docker run -p 80:80 -v $PWD/fasta:/var/www/html/fasta count-seq-image