@@ -23,21 +23,18 @@ Je ne vais pas décrire ici tous nos services, mais uniquement me concentrer sur
### Cluster ISE-M
**Le cluster de calcul de l'ISE-M** est réservé au personnel de l'ISE-M. Sa création précède l'existence du _LabEx_.
Ce dernier dispose de plusieurs queues dont certaines sont privées. Les files d'attente (`queues`) sont :
**Le cluster de calcul de l'ISE-M** est réservé au personnel de l'ISE-M. Sa création précède l'existence du _LabEx_. Ce dernier dispose de plusieurs queues dont certaines sont privées. Les files d'attente (`queues`) sont :
```bash
qconf -sql
> bionic.q
> intron_dyn
> long.q
> mem.q
> migraine
> small.q
```
`migraine` et `intron_dyn` sont 2 queues privées. Les autres sont disponibles soit directement, soit après demande en faisant un ticket [ici](https://kimura.univ-montp2.fr/calcul/helpdesk_NewTicket.html)(voir[cet article](cluster.md#acces-aux-queues) pour voir à quoi vous avez accès).
Ces queues sont disponibles soit directement, soit, pour la queue mem.q après demande en faisant un ticket [ici](https://kimura.univ-montp2.fr/calcul/helpdesk_NewTicket.html)(voir[cet article](cluster.md#acces-aux-queues) pour voir à quoi vous avez accès).
La queue `bionic.q` est une queue expérimentale sous Ubuntu 18.04 avec dans l'idée, une éventuelle migration du reste du cluster sous ce système. Les machines dans la queue `mem.q` disposent de plus de mémoire, mais sont accessibles qu'après en avoir fait la demande. La queue `small.q` est limitée, pour l'exécution des jobs, à une durée de 10 heures.
Les machines dans la queue `mem.q` disposent de plus de mémoire, mais sont accessibles qu'après en avoir fait la demande. La queue `small.q` est limitée, pour l'exécution des jobs, à une durée de 10 heures.
La queue `long.q` sera donc certainement votre queue par défaut sur ce cluster.
...
...
@@ -47,6 +44,8 @@ qhost -q
```
Si jamais la queue `mem.q` ne suffit pas à faire tourner vos travaux, vous avez alors la possibilité de réserver une machine `bigmems`.
Pour avoir des détails sur une queue : `qconf -sq <le_nom_de_la_queue>`
### Cluster MBB
...
...
@@ -95,8 +94,7 @@ Nos services sont soumis aux chartes de nos tutelles que sont notre organisme d'
Pour tout travail utilisant les service de la plateforme calcul et bioinformatique de Montpellier Bioinformatics Biodiversity, merci d'inclure cette formule dans vos publications: