Commit d08c4816 authored by peguerin's avatar peguerin
Browse files

add underlying data figure 2

parent c95578cc
......@@ -213,6 +213,17 @@ legMatCol=matrix(
byrow = FALSE)
##########################################################################
##write tables
data.frame(gd=Mr$GD_mean,richness=Mr$richness)
write.table(data.frame(gd=Mr$GD_mean,richness=Mr$richness)
,"14-tables/figure_2a_underlying_data.tsv",col.names=T,row.names=F,sep="\t")
write.table(data.frame(gd=Fr$GD_mean,richness=Fr$richness)
,"14-tables/figure_2c_underlying_data.tsv",col.names=T,row.names=F,sep="\t")
##########################################################################
## write pdf files
#tiff(filename="10-figures/figure2_colorblind.tiff",width=20,height=16,units="cm",res=640,compression="lzw")
......
"gd" "richness"
0.008196615203022 17.9333333333333
0.006403025875865 184.25
0.000749821024312 125.5
0.003453279848985 8.6
0.009674056812119 553.5
0.004412891730333 135
0.013803680981595 202
0.004336987122623 23.5
0.004031754691461 160.666666666667
0.002073925128471 47
0.004879217188163 39.875
0.001706484641638 169.333333333333
0.001703030770892 106
0.011524157909295 69.25
0.002304147465438 132.625
0.003595995377562 88.25
0.003456383204375 48.3
0.147928935922325 125.333333333333
0.00123750588888 119.5
0.002791113803285 77.875
0.002492576468194 53.7
0.000773431994362 8.57142857142857
0.002798081727263 48.625
0.003948921179059 57
0.000512032770097 8
0.227566308617513 28.75
0.002196382428941 51.3
0.029159265979883 294.5
0.043556911491176 297.75
0.002035824490103 43.3
0.00536544213256 1055.5
0.003107760645804 178.166666666667
0.00077519379845 39.6
0.003189792663477 488.5
0.006666805047554 1103.5
0.008426943096531 167.666666666667
0.007208096086687 19.4
0.003995501863478 21.3
0.003584229390681 247.555555555556
0.004232828442417 157.555555555556
0.005047338496152 24.0666666666667
0.018310677984408 764.5
0.008089846926298 546.5
0.003300501123207 139
0.002634186674746 138.333333333333
0.003451181697226 20.8
0.017883161164601 700.25
0.005642637618589 22.7
0.004834786672657 669
0.003386524402794 149.166666666667
0.011819612751512 239.833333333333
0.002953127190345 166.5
0.022333541056417 213.25
0.015223219765454 291.166666666667
0.020327939798328 268.25
0.002987440319973 63.8333333333333
0.002741047079007 271.5
0.003640572864824 293
0.01127821667684 291
0.012752955127812 346.666666666667
0.006719427152204 204.25
0.003775684479115 392.166666666667
0.001256039008499 210.666666666667
0.00208559965385 86.6666666666667
0.014583514423026 66.5
0.002039467463659 638
0.017331020796902 748.75
0.003077584911252 189
0.017583394088307 244
0.015931978659146 484.5
0.006843932406305 529
0.003067484662577 1003.25
0.001022494887526 84.5
0.000996980912525 205
0.00641018501496 68.6666666666667
0.0069978954419 613.5
0.019304434639301 487
0.001780413413081 629
0.018643490115883 271.5
0.003343230582035 403.5
0.015728158031225 968
0.009870523698934 1645.5
0.008885533758572 1063
0.006971037973455 366.75
0.027278940419526 1340
0.014199801120561 648.75
0.004370812767398 117.5
0.009298753662089 1180.25
0.005832932816903 701.5
0.001510121801656 1405
0.079856527141415 1208.5
0.019222903885481 309
0.005507939372068 811.5
0.035110670034885 876
0.01183732964923 921.5
0.002434408040726 273
0.002530933633296 197.5
0.006501513114957 1689
0.002676411284342 844.25
0.005576152616514 1087.25
0.024758707507223 173.75
0.00450390911772 1749.5
0.012147194962152 1550.75
0.00013633265167 453.5
0.001912322482602 332.25
0.098032484399252 904.5
0.010691344151368 1292.5
0.002558593197817 1573.25
0.010195722521705 1042.5
0.004864169061711 938.25
0.011571807156667 537.75
0.004625117061331 38.8333333333333
0.000914236601539 66.25
0.010477063917267 92.75
0.003069847901916 809
0.018466621251612 526.5
0.042515227788698 202.75
0.097430057539448 133
0.121134775328116 184.5
0.042327941091244 1352.5
0.000924925833117 78.75
0.00501123481675 833
0.001278118609407 789
0.001301822988523 700.5
0.000972316897675 49
0.004059315588661 619.333333333333
0.007696096480302 421
0.012715492752061 803.666666666667
0.005051380552157 687
0.002202557562676 685.833333333333
0.009594173245842 372.166666666667
0.00191717791411 140.166666666667
0.000766871165644 88.75
0.00177225764198 145.25
0.002629272567923 121.75
0.000925238978456 137
0.003116610992963 318.5
0.008299848530851 1340
0.015403337571361 662.5
0.002267695139814 161.75
0.005426356589147 158.333333333333
0.000426039536469 218.5
0.001278118609407 164.75
0.002968088320543 877.25
0.020704686091642 1068.25
0.002183554748093 565.75
0.002655100295106 452.5
0.001866348344414 362.666666666667
0.015645778396675 304.5
0.002242545986884 59.125
0.002302973100519 120.333333333333
0.003510791106514 162
0.00031007751938 190
0.003911042944785 154.25
0.013797810627938 1139.75
0.018257433937185 910.75
0.003067484662577 123.5
0.001686875402598 429.5
0.004067017208374 616
0.002587877940089 270.333333333333
0.003067484662577 60.5
0.016873998683555 324
0.004715820823572 228.25
0.005166984205812 624.5
0.00254567870126 78.25
0.020635274173002 239.25
0.00706450388274 439.25
0.004594202219829 84.5
0.050859830990688 689.5
0.014802036335561 471.25
0.001671003318135 220.25
0.005997311699261 507
0.00812505653707 247
0.011221098748973 325.75
0.002686405058758 419.166666666667
0.004057508656982 63.375
0.026193606276867 437.333333333333
0.003290068583671 66.8333333333333
0.000818330605565 131
0.028325929881834 332.75
0.01792827870358 105
0.003218721413534 55.5555555555556
0.006707676188311 256
0.0058712013317 292
0.001575630252101 155
0.01095219420322 224.75
0.003244134095548 156.833333333333
0.006674501742885 79.125
0.003892456965452 100
0.008249316686759 92.5
0.004451038575668 198.833333333333
0.019724260343116 458.75
0.016107829628592 343
0.00219298245614 182.666666666667
0.002019427402863 233.5
0.000775243269221 197.166666666667
0.010603843719475 408.5
0.014732098334865 254.5
0.000326413369892 455.25
0.006862686303264 5.4
0.00483190227599 20.4
0.002211832812948 0.714285714285714
0.013035831351933 84.25
0.001784271056093 442.75
0.019618684202075 16.6
0.00503352692712 11.7857142857143
0.001285884239711 691.5
0.00316164191801 264.666666666667
0.012270977753392 60.25
0.017280881479078 73.5
0.030981595092025 72
0.002268887198389 344.166666666667
0.019466073414906 13.8571428571429
0.002103137316829 383
0.00442260639125 174.833333333333
0.009125899868073 318
0.004668051434804 299.5
0.00528124664061 383
0.017005747466407 241.166666666667
0.002012283654798 361.333333333333
0.000512820512821 12.1428571428571
0.005626496092326 220
0.008223038355918 342
0.005352573888718 299.25
0.029795158286778 155.75
0.001279779165109 271
0.010048467204714 87.8333333333333
0.000371048288633 187
0.002531106049964 5.21428571428571
0.007006580998857 7
0.000566264274062 142.166666666667
0.029495715305935 23.5
0.002059301523088 180.75
0.001931368813915 115.25
0.001866484541065 142.25
0.002516692274551 155.333333333333
0.009562692997791 147.333333333333
0.030828784738478 383.75
0.000952327628006 52.75
0.001528811201753 191.5
0.000706930171972 146.833333333333
0.007707519218179 125.666666666667
0.006656373505976 188.75
0.002597997175408 187.5
0.033912747102931 152.833333333333
0.003400414433786 117.666666666667
0.011678797942325 183.25
0.001661995767543 118.25
0.002459669035766 194
0.00819194372619 177.333333333333
0.007040158697097 36.5
0.005368098159509 190
0.003512404684323 198.25
0.001987926807013 297.5
0.001201431492843 186.75
0.002506497755904 36.3333333333333
0.008825428306269 89.5
0.000172265288544 99.5
0.003918446220665 143.666666666667
0.000781303103703 35.8333333333333
0.001304898237414 288
0.007470077913787 367.25
0.00392015233166 219.5
0.003785013895443 82
0.000920245398773 221.75
0.003440739972912 146.25
0.009838865315467 482.25
0.002948502921087 470.75
0.008703388665885 208.75
0.002669319975297 193.75
0.000511247443763 93.5
0.005519718785789 248.25
0.001655931031754 75.75
0.003235643784354 493.75
0.007823598210512 94.75
0.008392394604255 226.5
0.00178936605317 46.8333333333333
0.006926737696644 801.833333333333
0.002385212776317 302
0.006696486611628 131.5
0.000797655548993 49
0.000826446280992 330.75
0.00820304727182 832
0.009999230857271 95.75
0.003853866229633 233.75
0.006834371213497 73
0.002656876777479 265
0.002530674846626 233.25
0.011742776779763 145
0.014415103139386 584
0.004395604395604 234
0.005275667330273 220.25
0.004911786000076 71
0.003067484662577 844.75
0.0305038163509 213.75
0.003431106250971 57
0.030189658793217 814.75
0.011656884364416 519.5
0.003304849547181 116.75
0.019146862576217 1215
0.023723670851128 780
0.00079464664418 990.25
0.058843683851756 463.75
0.011206530063805 247
0.012080580462482 124
0.006666666666667 68.25
0.009309398903537 1848.33333333333
0.013051994528588 1023.5
0.021754026222719 302.5
0.008288928774496 1524.5
0.002280634723409 1842.5
0.002001041099032 45
0.003066917249313 1070.5
0.002768265634715 104.166666666667
0.023412788412647 1329.75
0.079863139778236 742
0.006571072904497 75
0.001046232170141 110
0.017400522439888 955.25
0.048876567791935 1835
0.002317410522132 76.8333333333333
0.000992063492063 106
0.001526717557252 931
0.004963354154075 76.2222222222222
0.01276028098728 923.333333333333
0.031963147863523 838
0.018265266665084 1164.5
0.006372333642969 98
0.014994408151489 2306
0.017760534718157 1014
0.022796254669798 642.5
0.009959962773649 2072.75
0.015813564763873 2273.25
0.019081264120431 506.75
0.074165093755059 1851.5
0.00744332919945 2354.5
0.00805180900284 1250.75
0.011299528968898 1256.5
0.008940324344046 605
0.020420816050708 1213.5
0.006164436873527 399.5
0.004833915235614 1476.83333333333
0.013692902965094 615.5
0.007334449013694 1266.25
0.007180925022426 2762
0.015165986296767 2224
0.014062235433523 1191
0.012744287850865 1569.75
0.005024118810495 523.5
0.021660609973139 3016
0.071675424650574 2037.5
0.023885099516066 2211
0.001533742331288 35.6666666666667
0.142871128349525 1780.5
0.017318863660183 1721.5
0.004273789485596 2521.75
0.008872569850513 1586.5
0.021410897503542 791.5
0.019795783263845 1976.5
0.032426206552705 709.25
0.285679034923112 1900.5
0.01113497631091 2849.5
0.0284128843962 2573.5
0.006968781229719 2262.25
0.007090561418799 2142.5
0.001533742331288 2893.5
0.005323150724204 631
0.017402941543145 2055.5
0.03090224798614 2053.5
0.005807316388208 2162.5
0.112730061349693 2341.5
0.011216130089102 1712
0.032624081538448 2737.5
0.002026018340798 2377.25
0.033101510555805 3545.25
0.014895574722072 1804.5
0.006578010056554 751.5
0.020969825722899 1458.75
0.027364720882175 2772
0.008008888639586 2979.5
0.002083018100342 873
0.062050859101112 944
0.00422935691155 1536.25
0.020347648261759 1304
0.037457068360057 2455.5
0.004817846158172 1575.5
0.002260108432948 19.25
0.039723926380368 985.5
0.023958651927906 472
0.049620887794821 980.75
0.004833440680253 59.25
0.075755163208917 784.666666666667
0.004549261633363 1132
0.041820764113311 973.5
0.002288941180865 520.333333333333
0.002347417840376 707.166666666667
8.49294139903153e-05 90
0.026432058373994 232.25
0.002174483065907 531.25
0.001527798655946 41.3333333333333
0.003623973724793 48.6666666666667
0.061345870840739 12.375
0.002802872905821 2386
0.002000491716419 851.75
0.003447407858381 640.25
0.003596311225083 45.1666666666667
0.003921359039882 1391.75
0.013150818510853 7.66666666666667
0.003067484662577 7.5
0.003833469679696 39.5
0.000511247443763 443.25
0.001658627203047 3254
0.001533742331288 244.75
0.001796627904212 718.75
0.00077519379845 712.5
0.009246181209458 2716.5
0.014278975503456 1937.5
0.030520067437831 330.5
0.024306025946211 579.5
0.011538845638249 2247.25
0.003174368817363 2774.5
0.002889056857311 18
0.003547722015488 685.25
0.002127134702292 1199.5
0.000764140508046 1048.25
0.001578559477332 1785.5
0.041812006061564 1801.25
0.002739834496718 82.8333333333333
0.001330123317354 491
0.00230352303523 466
0.008061925606255 70.1666666666667
0.000508905852417 56
0.008921399591933 56.1666666666667
0.001993865030675 20.3333333333333
0.00191717791411 19.7
0.001365420720259 3.65384615384615
0.001363865395968 33.4
0.006819517930629 89.5
0.001277965388395 40.3
0.006158441044945 31.6
0.001271064347118 77
0.006454712546896 53.8
0.002141547303074 103.833333333333
0.006616364002748 17.25
0.006050543282764 33.8333333333333
0.00068271036013 14.5
0.002102045042005 46.6
0.00376054565044 20.1666666666667
0.006513706499299 36.7
0.032134193907298 930.5
0.000999121164229 18.3333333333333
0.007745053152624 14.875
0.002556152927121 12.2
0.001937792730391 23.1666666666667
0.004782528336133 26
"gd" "richness"
0.000613496932515 92.6666666666667
0.000758894793936 76.3333333333333
0.014826175869121 78.25
0.001806407634628 56.5
0.000766871165644 96.75
0.002629272567923 124.5
0.011844231437969 341
0.002351738241309 104
0.014826175869121 209.25
0.01840490797546 81
0.004089979550102 200
0.010863979401606 502
0.020289745802991 178
0.019198870951511 77.25
0.020523139914929 217
0.007077647839106 208
0.005981595092025 502
0.017142153648547 177.5
0.009817637511072 125
0.021894488909369 150.5
0.005623721881391 143.25
0.026873636513773 173.75
0.003834355828221 175.5
0.008680417231031 354
0.024539877300614 502
0.016257668711656 502
0.004479995150726 502
0.039731229915279 154.333333333333
0.014826175869121 298
0.01351264753732 457.5
0.009069418422181 502
0.014639606896752 502
0.015512936725542 10.2222222222222
0.021162560650421 435.25
0.014655760054533 507.5
0.013887282510309 502
0.009231550354618 502
0.016385321800099 502
0.009713701431493 502
0.004447852760736 502
0.009032038173142 502
0.004192224610143 324
0.007129927228581 188
0.017455911298569 240.25
0.036975332310838 463.75
0.019697264916393 532.5
0.016343066235053 502
0.001704158145876 502
0.014826175869121 502
0.015131258957094 502
0.007038683086279 521.5
0.015644171779141 316.5
0.0011650263023 28.25
0.012480745726737 180.25
0.017413096691026 250.75
0.008242440934143 547.75
0.01307943525824 502
0.029959918200409 502
0.006490191974416 515
0.011201630211556 447.75
0.017105584427277 287.25
0.009032038173142 207
0.011083619669 149
0.035413564086012 270.25
0.005341376102031 491
0.006092486692435 502
0.014621676891616 502
0.006850715746421 515
0.036459515675908 115
0.021472392638037 163
0.011631922758246 416.75
0.007166228454572 502
0.01570294446398 502
0.013271131561009 521.5
0.008241308793456 207
0.007992258252994 46.5
0.026572146463912 126.5
0.003067484662577 132
0.009082858603564 262.75
0.006735289490973 538.5
0.014078106448278 515
0.013312651907899 287.25
0.00536658776188 207
0.015337423312883 207.666666666667
0.01320641412666 156.25
0.002408826226285 267
0.002665790242477 436.75
0.006532782093571 510
0.008590536788139 369.75
0.007503883856558 207
0.005099693251534 207.333333333333
0.008265167007498 149.5
0.003600507460426 126
0.010638161044335 207
0.086424157458628 2273
0.002329311625957 2476.5
0.015287160458291 145.5
0.018741279236602 212
0.005587204206836 207
0.029327461275079 2273
0.084008684722404 1288
0.012764683800894 302.5
0.00370533527784 191.5
0.010157938810287 216.5
0.005086813524532 207
0.008529817650801 207.166666666667
0.000511247443763 2273
0.026025641025641 2273
0.00039603960396 1895.5
0.089041138277802 2273
0.000914159119681 2273
0.048878570200211 2273
0.01620654396728 49.3333333333333
0.016578454147396 2273
0.001495469733735 2273
0.008008991008991 2273
0.017842535787321 31
0.050764318879194 2273
0.019062226117441 6
0.058852310978995 46.25
0.009317026623016 552.5
0.019204065688677 1048.5
0.076850891044439 2273
0.022388419358469 2273
0.049230769230769 2273
0.027046261862637 2345.5
0.011248717322403 318
0.084840170359225 699.25
0.015836461824423 1047
0.015133965790455 1523.75
0.014036714083433 2954
0.021996910099982 11
0.051707363410576 1047
0.05012512344615 1047
0.043476976427061 2477.25
0.168714183201901 2273
0.026102433945074 2273
0.039566474108399 797
0.06459281312588 1140
0.001854216489432 1047
0.008409302001559 1047
0.012183507315153 1047
0.096779272620335 1047
0.000438212094654 2273
0.000374111485223 1417.5
0.000505050505051 427.5
0.014618831189362 173.75
0.023969219179773 223.5
0.039246662402707 984
0.037546661684194 1047
0.014718454346237 1047
0.059944131473832 1047
0.024344404611568 1266
0.019795338294087 1047
0.042733479227869 2393
0.092745571298228 2273
0.001414141414141 364
0.031669131795314 343.5
0.044184546329459 438
0.098898400392688 1109
0.010999154385423 1067.5
0.016140863933549 1047
0.021429564978713 1047
0.052609360062664 536