Utilisation de singularity plutot que Docker
Pour faciliter les choses, il pourrait être interessant d'utiliser unqiuement singularity comma outil de containerisation (même en local) pour l'utilisation du MBB workflow. Ca permettrait d'avoir un unique outil de containerisation. (plutot que docker en local et singularity en hpc)
Tout comme docker il est possible de directement modifier un container grace au ligne : sudo singularity build lolcow.img shub://GodloveD/lolcow singularity run --fakeroot --writable lolcow.sif
L'image singularity fait environ 2 Giga alors que l'image docker 3.1 giga.
Inconvénient de tout passer en singularity
- Nécessite les droit sudo pour construire le container
- Pas de stockage pssible de l'image sur docker hub
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